Հայաստանի Հանրապետության կառավարության որոշմամբ Մհեր Անանյանը նշանակվեց ՀՀ սպորտի և երիտասարդության հարցերի նախարարության աշխատակազմի ղեկավար։ ՀՀ վարչապետ Հովիկ Աբրահամյանը շնորհավորեց Անանյանին՝ նոր պաշտոնում նշանակվելու կապակցությամբ և մաղթեց հաջողություններ:
Անանյանը 2006-2013 թվականների ընթացքում զբաղեցրել է ՀՀ դատական դեպարտամենտի Ֆինանսաբյուջետային վարչության պետի պաշտոնը:
